No software Intel® Quartus® Prime Pro Edition, você pode adicionar uma atribuição preserve register Quartus Setting file (.qsf) para evitar que um registro seja colocado no Hyper-Register.
Para resolver isso, use o seguinte arquivo de configuração de Quartus (.qsf):
set_instance_assignment -name PRESERVE_REGISTER ON -to core_inst|top_inst|local_reg[*]