Quando um projeto foi copiado com o banco de dados compilado (qdb), você pode ver que os arquivos abertos do Project Navigator são do projeto original que foi copiado. Esse problema ocorre quando o projeto não foi recompilado. O Project Navigator usa caminhos absolutos criados durante a análise e elaboração, que ainda apontarão para o projeto original que você copiou.
Este problema ocorre no software Intel® Quartus® Prime Pro Edition versão 19.1 e anterior.
Para resolver este problema, reprise Análise e Elaboração no projeto copiado.
Este problema é corrigido a partir do software Intel® Quartus® Prime Pro Edition versão 20.1.