Sim, devido a um problema com a geração de modelos Cyclone® V IBIS nas versões do software Quartus® Prime 16.0 e anteriores, você verá o comportamento do modelo trocado para a configuração de pré-ênfase do LVDS.
Para pré-ênfase HABILITADO - _p1: o resultado da simulação mostra a pré-ênfase desabilitada.
Para a pré-ênfase DISABLED-_p0: o resultado da simulação mostra a pré-ênfase habilitada.
Para resolver este problema, altere manualmente a configuração de pré-ênfase ao gerar o modelo IBIS nas versões afetadas do software Quartus Prime.
Este problema é corrigido nas versões 16.1 e posteriores do software Quartus Prime.