O software Quartus® II versão 9.1 pode gerar incorretamente este aviso, se o seu projeto implementar uma ALTGX_RECONFIG megafunção. Este aviso ocorre porque o software Quartus II detecta que o LPM_MUX dentro da ALTGX_RECONFIG megafunção registra pinos de clock.
Você pode ignorar com segurança este aviso para os nós dentro da megafunção ALTGX_RECONFIG, porque apenas uma entrada específica do LPM_MUX está ativa em um determinado momento, de modo que uma falha não ocorra na saída.
Este problema está programado para ser corrigido em uma versão futura do software Quartus II.