Esse tipo de incompatibilidade pode ocorrer quando uma porta não estiver despropulsa no design dourado. Neste caso, o Encounter Conformal atribui um valor "Z" na porta sem unidade, mas o design revisado tem um valor predefinido para essa porta atribuída pelo Quartus® SOFTWARE II. O Encounter Conformal detecta que os designs não são funcionalmente equivalentes e relata uma incompatibilidade relacionada às portas.
Em alguns casos, o problema ocorre quando você usa instações de VHDL de alguns Altera®megafunções. Para evitar este problema, gere sua variação de megafunção no HDL Verilog.