O comando Copiar Projeto não funciona corretamente quando um projeto está localizado em um diretório que contém espaços no nome.
Certifique-se de que seu projeto está localizado em um diretório sem espaços no nome. Você pode renomear o diretório para usar um símbolo, como o sublinhado (_) como um suporte de lugar em vez de espaços (por exemplo, my_design).
Este problema foi corrigido a partir do software Quartus® II versão 5.1.