O procedimento escrito na Nota de aplicativo 638 não é apropriado se você usar a licença Open Core plus.
Se você compilar o projeto com a licença Open Core plus, o arquivo SOF limitado por tempo será gerado.
Para configurar o arquivo SOF, você precisa usar o programador Quartus® II em vez do comando nios2-configure-sof, conforme escrito na Nota de aplicativo 638.
Após configurar o FPGA pelo programador Quartus II, você pode abrir um shell de Nios II comando e digitar "console do sistema".