Devido ao bug quartus® II, você pode obter erros de porta ausentes do SERDES, como rx_signaldetect, tx_pipemargin ou tx_pipedeemph após regenerar o núcleo PCIe em uma versão quartus diferente. Este problema está documentado na Tabela 20-2 em Notas de versão da biblioteca IP Megacore e Errata (PDF).
Execute as seguintes etapas para resolver este problema:
1.Remova _serdes.v no diretório do projeto
2.Regenerar o núcleo PCIE usando o MegaWizard ou o sopc builder.