Devido a um problema no software Quartus® II versão 12.1 SP1 e anterior, você pode ver um desses erros internos durante a compilação, se você estiver usando reconfiguração parcial. Este erro pode ocorrer se você tiver um clock dual-regional que tenha fanout apenas em um quadrante.
Para resolver este problema, altere esses recursos para clocks regionais que cobrem apenas um quadrante ou certifique-se de que o clock tenha fanouts em ambos os quadrantes.
Este problema está programado para ser corrigido em uma versão futura do software Quartus II.