Devido a um problema na versão 18.1 ou anterior do Software Quartus® Prime Pro Edition, você pode ver que as definições de biblioteca para entidades VHDL com mesmo nome são ignoradas e uma única entidade é usada em várias instâncias, independentemente de cada entidade, ser definida como bibliotecas separadas.
Para contornar esse problema, use o nome exclusivo de cada entidade na VHDL.
Este problema foi corrigido a partir da versão 19.1 do Software Quartus® Prime Pro Edition.