Devido a um problema nas versões do software Quartus® II 13.0 SP1 e anterior, você pode ver violações de tempo de espera em seu Altera DDR3 IP para caminhos em que o registro de origem e de destino são colocados dentro de uma única ALM. O problema ocorre devido a uma limitação de colocação e roteamento específica para o IP DDR3.
Para evitar esse problema, comente (usando #) todas as atribuições de FORM_DDR_CLUSTERING_CLIQUE geradas automaticamente no arquivo de configurações do projeto Quartus II (.qsf).
Este problema está programado para ser corrigido em uma versão futura do software Quartus II.