Devido a um problema nas versões de software Quartus® II 13.0 e 13.0 SP1, os arquivos Synopsys Design Constraint (.sdc) chamados usando o comando read_sdc podem ser lidos duas vezes durante a compilação. O problema afeta designs usando compilação incremental e é específico para casos em que o arquivo .sdc read_sdc é fonte usando o comando de outro arquivo .sdc em vez de ser adicionado ao projeto.
Para evitar este problema, adicione seus arquivos .sdc ao seu projeto Quartus II em vez de sourcing-los a partir de outros arquivos .sdc usando o read_sdc comando.
Este problema está programado para ser corrigido em uma versão futura do software Quartus II.