Sim, há um problema com o arquivo BSDL de pós-configuração para dispositivos Cyclone® IV E que é gerado no software Quartus® II versão 11.0 SP1.
Quando a migração de dispositivos estiver habilitada no software Quartus II, o arquivo BSDL de configuração de postagem extraído tem um erro. Para pinos que funcionam como E/S no dispositivo selecionado atualmente, mas funcionam como pinos de alimentação no dispositivo de migração direcionada serão impressos como pinos de E/S usáveis que não devem estar no arquivo BSDL de configuração pós-configuração.
Para evitar o erro no arquivo BSDL de pós-configuração para dispositivos Cyclone IV E gerados no software Quartus II versão 11.0 SP1, desligue a migração do dispositivo.
Este problema é corrigido no software Quartus II versão 12.0.