Para resolver este problema, combine os sistemas Qsys em um único sistema Qsys.
Se você não conseguir combinar os sistemas Qsys, siga estas etapas:
1) Mova os arquivos Qsys afetados para a parte superior e inferior da lista de arquivos
2) Quando você ver o primeiro qsys afetado terminar a elaboração, navegue até a pasta /db/ip//submodules e exclua alt_cusp151_package.vhd antes que o segundo sistema Qsys elabore
Este problema está programado para ser corrigido em uma versão futura do software Quartus Prime.