Um problema foi identificado com o algoritmo de geração de Qsys e gerenciamento de projetos que resulta em geração de códigos não determinísticos. O HDL é válido em cada geração de executar, no entanto, a ordem das instâncias pode variar de executar a executar. Este problema foi visto em todas as versões dos Qsys 11.0 e 11.1 (com e sem pacotes de serviço).
Este problema será resolvido na versão 12.0 da Qsys.