Você não é capaz de habilitar a opção "Habilitar gravação contínua de todas as palavras necessárias para reconfiguração" no controlador ALTGX_RECONFIG devido a um erro de software no software Quartus® II v11.0 e v11.0 sp1. O ALTGX_RECONFIG de parâmetros permite que você faça o check-off desta opção, mas esta configuração não afeta internamente. Se você reabro o editor de parâmetros ALTGX_RECONFIG, você encontrará esta opção não marcada, mesmo que você tenha verificado anteriormente.
Para resolver o problema, altere o diretório para a pasta que contém o arquivo de editor de parâmetros ALTGX_RECONFIG gerado e execute o seguinte comando no prompt dos DOS ou Linux:
qmegawiz -wiz_override="enable_full_write=true,data_latency=2"
Este problema foi corrigido a partir do software Quartus® II v11.1