Você pode obter este erro se o arquivo Quartus® II IP (qip) gerado pela megafunção Altera_PLL não estiver sendo referenciado durante a compilação Quartus II. Este arquivo .qip contém a atribuição necessária do clock de feedback e sem ele, você verá este erro.
Adicione o arquivo .qip gerado pela megafunção Altera_PLL ao seu projeto, acessando o menu Projeto no software Quartus II e selecione Adicionar/Remover Arquivos no Projeto...