Devido a um problema no software Quartus® II versão 10.0 e posterior, você pode ver a mensagem de erro no software ModelSim-Altera Edition versão 6.5e quando você simula um arquivo de variação de megafunção ALTDDIO_IN gerado em VHDL.
Para resolver o problema, comente a seguinte linha no arquivo de variação VHDL (.vhd) mencionada na mensagem de erro gerada pelo software ModelSim-Altera Edition:implement_input_in_lcell => "ON"
Este problema será corrigido em uma versão futura do software Quartus II.