Quais as novas: Como resultado de uma colaboração contínua com a Intel e o Google Cloud para acelerar a pesquisa genômica, o Broad Institute of MIT e Harvard otimizaram seus fluxos de trabalho para instâncias rápidas e econômicas do Google N1 e N2. Em comparação com a implantação inicial de cargas de trabalho no Google Cloud, a colaboração resultou em uma redução de 85% no custo de processamento de dados após a otimização1.
"Sabíamos que a nuvem permitiria um novo nível de federação de dados e colaboração, e poderíamos trabalhar com outros para criar um ecossistema de dados baseado em nuvem, onde os pesquisadores poderiam combinar seus fluxos de trabalho em mais do que os dados gerados com outros conjuntos de dados em experimentos computacionais mais ricos e poderosos."
Como funciona: Para se adaptar a um aumento dramático na geração de dados de genômica e na demanda de pesquisa computacional, o Broad Institute migrou suas cargas de trabalho para instâncias do Google Cloud N2. Ao modularizar seus fluxos de trabalho de pipeline, instâncias de nuvem de dimensionamento certo com base nas necessidades da carga de trabalho e otimização para processadores Intel® Xeon® Escaláveis, os usuários do Broad Institute podem executar seus fluxos de trabalho genômicos no Google Cloud cerca de 25% mais rápido e a um custo 34% menor, implantando em instâncias N2 com processadores Xeon Scalable1.
A Intel tem uma parceria com o Broad Institute desde 2017, ajudando a otimizar os pipelines do instituto e o Kit de Ferramentas de Análise de Genoma (GATK) com bibliotecas Intel, incluindo a Biblioteca de Kernel de Genômica Intel®. Juntos, eles também gerenciam o Intel-Broad Center for Genomic Data Engineering, um projeto que permite que pesquisadores e engenheiros de software em todo o mundo construam, otimizem e compartilhem amplamente novas ferramentas e infraestruturas que ajudarão os cientistas a integrar e processar dados genômicos.
A Intel trabalhou com o Broad Institute para ajudar a otimizar seus pipelines no Google Cloud. Por exemplo, núcleos específicos no Kit de Ferramentas de Análise de Genoma são otimizados para operações vetoriais com extensões de vetores Avançados Intel® 512 (Intel® AVX-512). Algumas funções de armazenamento otimizadas usam a Biblioteca inteligente de aceleração de armazenamento (Intel® ISA-L) da Intel®.
Buscando realizar uma visão mais ampla do ecossistema das ciências da vida, o Broad Institute, a Microsoft e a Verily co-desenvolveram a plataforma Terra, uma plataforma escalável e segura para pesquisadores biomédicos em todo o mundo acessarem dados, executarem ferramentas de análise e colaborarem. Terra é construído sobre infraestrutura em nuvem, permitindo que o Broad Institute dimensione facilmente e capacite a comunidade de pesquisa com novas capacidades em benefício da pesquisa em soluções para doenças humanas.
Por que importa: A genômica mudou a forma como a ciência biológica é realizada. Com a ajuda da Intel e do Google Cloud, o Broad Institute está na vanguarda da inovação, permitindo e ajudando a acelerar a pesquisa de genômica. Ao migrar para a nuvem e otimizar cargas de trabalho para instâncias do Google Cloud, o Broad Institute resolveu seus desafios de capacidade de armazenamento e capacidade computacional de forma escalável e prospectiva. A co-construção da plataforma Terra permitiu ainda mais que o Instituto Broad capacitasse não apenas suas equipes de pesquisa, mas cientistas de vida em todo o mundo, para permitir que eles aproveitassem essas ferramentas e pipelines otimizados, e para permitir um ecossistema de dados federado que abre muitas novas possibilidades para pesquisas biomédicas.
Mais contexto: Equipe intel e google cloud com todos os eua programa de pesquisa
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