Para resolver este problema, você deve forçar o txclkout a usar um clock global com a seguinte atribuição QSF:
set_instance_assignment nome GLOBAL_SIGNAL "GLOBAL CLOCK" -para
"*sv_xcvr_native:inst_sv_xcvr_native|sv_pcs:inst_sv_pcs|sv_pcs_ch:ch[0].inst_sv_pcs_ch|sv_hssi_tx_pld_pcs_interface_rbc:inst_sv_hssi_tx_pld_pcs_interface|pld8gtxclkout"
Este problema será corrigido em uma versão futura do software Quartus II.