Você verá esta mensagem de erro, do Nios® II flash do programador, ao tentar programar arquivos binários grandes. A solução é copiar os arquivos incluídos sh_jar.sh_win32 (para windows) ou arquivo sh_jar.sh_linux (para Linux) para \bin. Depois de copiado, você terá que renomear o arquivo para sh_jar.sh antes de usá-lo.
Esta solução se aplica à versão 7.2 (versão inicial, bem como aos pacotes de serviço 1 e 2).
Este problema será corrigido em uma versão futura do software.