Devido a um problema no software Quartus® II versão 13.0 SP1 e anteriormente, no utilitário Converter arquivo de programação, a opção Habilitar a descompressão durante a reconfiguração parcial não é restaurada quando você abre o Arquivo de configuração de conversão (.cof).
Para resolver o problema, ligue a descompressão Habilitar durante a reconfiguração parcial na janela Propriedades de arquivo SOF após restaurar as configurações a partir do .cof.
Este problema é corrigido a partir do software Intel® Quartus® Prime Standard Edition versão 17.0.