O software Quartus® II versão 9.0 incorretamente permite que você defina a opção lógica de resistor fraco de pull-up programável em pinos de entrada de clock dedicados para projetos destinados a dispositivos Arria® II GX e informa esta opção conforme habilitado no arquivo de relatório de compilação.
Não há resistor de pull-up fraco programável disponível para pinos de entrada de clock dedicados durante a operação do modo de usuário. O resistor de pull-up fraco programável é suportado apenas em pinos de E/S do usuário para dispositivos Arria II GX conforme indicado nos recursos de E/S de dispositivos Arria II GX (PDF).
Este problema deve ser corrigido em uma versão futura do software Quartus II.