As versões do software Quartus® II 8.0 SP1 e anteriores no Linux ou UNIX não lêem arquivos quartus.ini do diretório quartus/bin , mas exigem que os arquivos quartus.ini estão nos seguintes locais:
- Os subdiretórios quartus/<linux/solaris> (conforme apropriado) dentro de uma instalação quartus II, se o quartus.ini for usado para todos os projetos
- Um diretório de projetos Quartus II, se o quartus.ini for usado apenas para o projeto atual ou local
O comportamento no Linux está programado para ser alterado para imitar o comportamento do Windows em uma versão futura do software Quartus II.