Para encontrar todas as versões do Cygwin instaladas, faça o seguinte a partir do "shell de comando Nios® II":
[SOPC Builder]$ cygcheck -s -v -r > cygcheck.out
[SoPC Builder]$ grep cygwin1.dll cygcheck.out
Isso exibirá todos os caminhos que têm qualquer referência a cygwin1.dll e mostrará as versões de cygwin1.dll instaladas na máquina.